Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM4Q9C037 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM4Q9C037 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms