Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRIM54Q9BYV2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRIM54Q9BYV2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms