Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
GABARAPL3Q9BY60 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GABARAPL3Q9BY60 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms