Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC8Q9BY41 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HDAC8Q9BY41 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HDAC8Q9BY41 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms