Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RSPO3Q9BXY4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RSPO3Q9BXY4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms