Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM106CQ9BVX2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms