Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NDC1Q9BTX1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NDC1Q9BTX1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms