Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RTKNQ9BST9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RTKNQ9BST9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms