Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV3

SLC50A1, Sugar transporter SWEET1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC50A1Q9BRV3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC50A1Q9BRV3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC50A1Q9BRV3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC50A1Q9BRV3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC50A1Q9BRV3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC50A1Q9BRV3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC50A1Q9BRV3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC50A1Q9BRV3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC50A1Q9BRV3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC50A1Q9BRV3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC50A1Q9BRV3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC50A1Q9BRV3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC50A1Q9BRV3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC50A1Q9BRV3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC50A1Q9BRV3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC50A1Q9BRV3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms