Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SH2D3AQ9BRG2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SH2D3AQ9BRG2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SH2D3AQ9BRG2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms