Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP7

MGME1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGME1Q9BQP7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MGME1Q9BQP7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MGME1Q9BQP7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms