Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TCF25Q9BQ70 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TCF25Q9BQ70 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms