Protein–RNA interactions for Protein: Q99959

PKP2, Plakophilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP2Q99959 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP2Q99959 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP2Q99959 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP2Q99959 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP2Q99959 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP2Q99959 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP2Q99959 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP2Q99959 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP2Q99959 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PKP2Q99959 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PKP2Q99959 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PKP2Q99959 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms