Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LYSTQ99698 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LYSTQ99698 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms