Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
PITX2Q99697 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PITX2Q99697 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms