Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NUP88Q99567 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP88Q99567 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms