Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
EYA3Q99504 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EYA3Q99504 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EYA3Q99504 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms