Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PHOX2BQ99453 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms