Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNKPQ96T60 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PNKPQ96T60 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms