Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRAPPC9Q96Q05 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAPPC9Q96Q05 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms