Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGLYRP2Q96PD5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PGLYRP2Q96PD5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PGLYRP2Q96PD5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms