Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZNF558Q96NG5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF558Q96NG5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZNF558Q96NG5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms