Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ZNF560Q96MR9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZNF560Q96MR9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms