Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NBPF4Q96M43 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NBPF4Q96M43 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NBPF4Q96M43 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms