Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C9orf72Q96LT7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf72Q96LT7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms