Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC41A2Q96JW4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC41A2Q96JW4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms