Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMX3Q96JJ7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMX3Q96JJ7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.6 ms