Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGSM3Q96HU1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGSM3Q96HU1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SGSM3Q96HU1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms