Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
ZC2HC1AQ96GY0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms