Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IMP4Q96G21 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IMP4Q96G21 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms