Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDC3Q96F86 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDC3Q96F86 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms