Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGF29Q96ES7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
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