Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MALSU1Q96EH3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MALSU1Q96EH3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms