Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C18orf8Q96DM3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
C18orf8Q96DM3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C18orf8Q96DM3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2072.9 ms