Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SHISA4Q96DD7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SHISA4Q96DD7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms