Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RCN3Q96D15 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RCN3Q96D15 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RCN3Q96D15 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms