Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHMP4CQ96CF2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHMP4CQ96CF2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms