Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ5

CCDC127, Coiled-coil domain-containing protein 127, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC127Q96BQ5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC127Q96BQ5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC127Q96BQ5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms