Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TSR2Q969E8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TSR2Q969E8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms