Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HGDQ93099 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HGDQ93099 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HGDQ93099 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HGDQ93099 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HGDQ93099 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HGDQ93099 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HGDQ93099 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HGDQ93099 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HGDQ93099 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HGDQ93099 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HGDQ93099 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HGDQ93099 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HGDQ93099 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HGDQ93099 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HGDQ93099 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HGDQ93099 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HGDQ93099 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HGDQ93099 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HGDQ93099 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HGDQ93099 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HGDQ93099 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HGDQ93099 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HGDQ93099 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HGDQ93099 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HGDQ93099 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HGDQ93099 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HGDQ93099 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HGDQ93099 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HGDQ93099 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HGDQ93099 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HGDQ93099 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HGDQ93099 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HGDQ93099 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HGDQ93099 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HGDQ93099 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HGDQ93099 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HGDQ93099 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HGDQ93099 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HGDQ93099 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HGDQ93099 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HGDQ93099 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HGDQ93099 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HGDQ93099 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HGDQ93099 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HGDQ93099 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HGDQ93099 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HGDQ93099 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HGDQ93099 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HGDQ93099 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HGDQ93099 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HGDQ93099 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HGDQ93099 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HGDQ93099 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HGDQ93099 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HGDQ93099 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HGDQ93099 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HGDQ93099 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HGDQ93099 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HGDQ93099 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HGDQ93099 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HGDQ93099 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HGDQ93099 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HGDQ93099 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HGDQ93099 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HGDQ93099 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HGDQ93099 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HGDQ93099 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HGDQ93099 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HGDQ93099 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HGDQ93099 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HGDQ93099 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HGDQ93099 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HGDQ93099 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HGDQ93099 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HGDQ93099 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HGDQ93099 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HGDQ93099 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HGDQ93099 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HGDQ93099 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HGDQ93099 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HGDQ93099 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HGDQ93099 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms