Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP13Q92995 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP13Q92995 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP13Q92995 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP13Q92995 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP13Q92995 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP13Q92995 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP13Q92995 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP13Q92995 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP13Q92995 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP13Q92995 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP13Q92995 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP13Q92995 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP13Q92995 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP13Q92995 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP13Q92995 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP13Q92995 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP13Q92995 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP13Q92995 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP13Q92995 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP13Q92995 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP13Q92995 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP13Q92995 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP13Q92995 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP13Q92995 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP13Q92995 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP13Q92995 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP13Q92995 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP13Q92995 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP13Q92995 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP13Q92995 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP13Q92995 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP13Q92995 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP13Q92995 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP13Q92995 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP13Q92995 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP13Q92995 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP13Q92995 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP13Q92995 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP13Q92995 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP13Q92995 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP13Q92995 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP13Q92995 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP13Q92995 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP13Q92995 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP13Q92995 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP13Q92995 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP13Q92995 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP13Q92995 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP13Q92995 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP13Q92995 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP13Q92995 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP13Q92995 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP13Q92995 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP13Q92995 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP13Q92995 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP13Q92995 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP13Q92995 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP13Q92995 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP13Q92995 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP13Q92995 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP13Q92995 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP13Q92995 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP13Q92995 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
USP13Q92995 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP13Q92995 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP13Q92995 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP13Q92995 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP13Q92995 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP13Q92995 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP13Q92995 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP13Q92995 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP13Q92995 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP13Q92995 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP13Q92995 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
USP13Q92995 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP13Q92995 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
USP13Q92995 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP13Q92995 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP13Q92995 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP13Q92995 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP13Q92995 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP13Q92995 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP13Q92995 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP13Q92995 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP13Q92995 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP13Q92995 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP13Q92995 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP13Q92995 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP13Q92995 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP13Q92995 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
USP13Q92995 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP13Q92995 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP13Q92995 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP13Q92995 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP13Q92995 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP13Q92995 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP13Q92995 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP13Q92995 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
USP13Q92995 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms