Protein–RNA interactions for Protein: Q92772

CDKL2, Cyclin-dependent kinase-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL2Q92772 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDKL2Q92772 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDKL2Q92772 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms