Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HERVK_113Q902F9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERVK_113Q902F9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERVK_113Q902F9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms