Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE0

CASKIN2, Caskin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN2Q8WXE0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CASKIN2Q8WXE0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CASKIN2Q8WXE0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CASKIN2Q8WXE0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms