Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF3

SSMEM1, Serine-rich single-pass membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSMEM1Q8WWF3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSMEM1Q8WWF3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSMEM1Q8WWF3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms