Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GIPC3Q8TF64 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GIPC3Q8TF64 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms