Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SH3RF2Q8TEC5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SH3RF2Q8TEC5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms