Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACTRT1Q8TDG2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTRT1Q8TDG2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms