Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UBA3Q8TBC4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UBA3Q8TBC4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms