Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LMO3Q8TAP4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMO3Q8TAP4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms